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L’impatto combinato delle infezioni persistenti e della variazione genetica umana su C

Nov 25, 2023

BMC Medicine volume 20, numero articolo: 416 (2022) Citare questo articolo

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Diversi agenti patogeni umani stabiliscono infezioni croniche, talvolta permanenti. Anche se spesso sono latenti, queste infezioni possono innescare un certo grado di risposta immunitaria locale o sistemica, provocando un’infiammazione cronica di basso grado. Rimane una comprensione incompleta del potenziale contributo sia delle infezioni persistenti che della variazione genetica umana sull’infiammazione cronica di basso grado. Abbiamo cercato potenziali associazioni tra sieropositività per 13 patogeni persistenti e livelli plasmatici del biomarcatore infiammatorio proteina C-reattiva (CRP), utilizzando i dati raccolti nel contesto della Biobanca del Regno Unito e dello studio CoLaus|PsyCoLaus, due grandi coorti basate sulla popolazione . Abbiamo eseguito una regressione graduale all'indietro a partire dai seguenti potenziali predittori: sierostato per ciascun patogeno, punteggio di rischio poligenico per CRP e fattori demografici e clinici noti per essere associati alla CRP. Abbiamo trovato prove di un'associazione tra la sieropositività di Chlamydia trachomatis (valore P = 5,04e - 3) e Helicobacter pylori (valore P = 8,63e - 4) e livelli plasmatici più elevati di CRP. Abbiamo anche trovato un'associazione tra carico di agenti patogeni e livelli di CRP (valore P = 4,12e - 4). Questi risultati migliorano la nostra comprensione della relazione tra infezioni persistenti e infiammazione cronica, un importante determinante della morbilità a lungo termine negli esseri umani.

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L’infiammazione è una risposta complessa e necessaria del sistema immunitario a stimoli dannosi come lesioni tissutali, infezioni o esposizione a tossine [1]. Durante la fase acuta, caratterizzata da cambiamenti del flusso sanguigno e da un aumento della permeabilità dei vasi sanguigni, le proteine ​​plasmatiche e i leucociti migrano dalla circolazione al sito dell’infiammazione [2]. Questa risposta protettiva immediata consente solitamente l'eliminazione della causa iniziale del danno cellulare e il ripristino dell'omeostasi. Tuttavia, quando la risposta acuta non riesce a eliminare il danno tissutale, ad esempio a causa dell’esposizione prolungata agli stimoli, l’infiammazione può diventare un processo cronico [3]. Un certo numero di malattie comuni sono almeno in parte causate da infiammazioni croniche, tra cui la malattia coronarica, il diabete di tipo 2 e alcuni tumori [4]. Pertanto, sebbene l’infiammazione svolga un ruolo importante nella difesa umana contro l’aggressività, contribuisce anche alla fisiopatologia di molteplici malattie di grande importanza per la salute pubblica.

Diagnostic tests are capable of detecting the presence and intensity of systemic inflammation [5]. The most commonly used inflammatory biomarker is the acute-phase reactant C-reactive protein (CRP). This ring-shaped protein is produced by hepatocytes upon stimulation by pro-inflammatory cytokines such as interleukin (IL)-1b, IL-6, and TNF-a. Although CRP is commonly used as a sensitive indicator of inflammation, the factors influencing its baseline plasma levels are only partially understood. Circulating amounts of CRP are positively associated with age, body mass index (BMI), and smoking and inversely with male sex and physical activity [6,7,8]. In addition, large-scale genomic analyses have found multiple associations with hs-CRP levels, mainly in the loci enriched in hepatic, immune, and metabolic pathways, such as CRP, LEPR, IL6R, GCKR, APOE, and HNF1A-AS1 [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="#ref-CR9" id="ref-link-section-d10595495e546">9, 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="#ref-CR10" id="ref-link-section-d10595495e546_1"> 10,11,12,13,14]. Complessivamente, la variazione genetica spiega fino al 16% della varianza nei livelli plasmatici di CRP [14].

We carried out a polygenic risk score (PRS) analysis to investigate the relationship between human genetic variation and hs-CRP levels. A CRP-PRS was calculated for each study participant based on the risk effects of common SNPs derived from GWAS summary statistics of hs-CRP. As a baseline cohort, we referred to the GWAS summary statistics of the CHARGE cohort (N = 204,402, heritability h2 = 6.5%) [ 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR10" id="ref-link-section-d10595495e675"10, 27]. These summary statistics were used to construct the CRP-PRS in our target cohort consisting of the merged UK Biobank and CoLaus|PsyCoLaus data using the clumping and thresholding method of the PRSice-2 v2.2.7 software [28]. We used a standardized method to obtain PRS, by multiplying the dosage of risk alleles for each variant by the effect size in the GWAS and summing the scores across all of the selected variants. SNPs were clumped based on linkage disequilibrium (LD) (r2 ≥ 0.1) within a 250-kb window. Model estimates of the PRS effect were adjusted for sex, age, BMI, and the top 10 PCs. As an additional quality control, the distribution of PRS was checked in each cohort separately, to ensure that they followed a normal distribution./p>

We first investigated the relationship between common genetic variation and hs-CRP levels by calculating a PRS for all study participants. The PRS explained about 4% of the variation in hs-CRP levels, in agreement with previously published results [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR9" id="ref-link-section-d10595495e1261"9]. We also found that BMI was the major non-genetic predictor of hs-CRP, with approximately 19% of the variance explained./p> 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8./p> 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706./p>